La didattica del Liceo San Raffaele si ispira alla «pedagogia del laboratorio», che sottolinea il carattere attivo dell’apprendimento e maieutico dell'insegnamento.

Un laboratorio che non si identifica necessariamente con luoghi o attrezzature particolari, ma con una  metodologia che riguarda ogni attività e momento didattico - disciplinare - formativo.

Pertanto, alla tradizionale strumentazione tecnica dei laboratori (scientifico, audiovisivo e di informatica) si affiancano momenti curricolari di lezione che risultano partecipati, condivisi, interattivi, in cui gli studenti sono reali protagonisti dell’apprendimento.

Sempre nella medesima ottica di laboratorio, si inserisce la variegata proposta di attività extra-curricolari di visite, conferenze, partecipazione a workshop operativi, spettacoli teatrali e musicali, scambi interculturali, stage orientativi presso aziende, reparti ospedalieri e laboratori di ricerca.